هیچ مدیر و مسئولی بجز خودم مردم محلی و روستایی نمی تواند مشکلات یک روستا را ارائه نماید. در همین راستا یکی از برنامه های توانمندسازی مناطق محروم و روستایی شناسایی و استخراج مشکلات روستا توسط خود روستائیان است که در این مرکز انجام می شود. بر این اساس مرکز طی جلساتی در روستاهای هدف خود با روش ترسیم درخت مشکلات به شناسایی مشکلات روستایی و حل آنها کمک می کند. در این جلسات مشکل اصلی که بالاترین رای را در میان مردم روستا دارد به عنوان تنه درخت مشکلات انتخاب می شود و سایر مشکلات شاخه ها و برگ های درخت را تشکیل خواهند داد.

در تمامی 185 روستای هدف این مرکز درخت مشکلات توسط مرکز و روستائیان ترسیم و در روستاها نصب گردید تا تمامی مردم محلی با انها اشنا شوند و برای حل انها راهکار ارائه نمایند